随着生命科学研究进入到后基因组时代，蛋白质组学的研究逐渐成为核心内容之一。质谱技术的不断发展和成熟，带来了高通量、高灵敏度和动态范围更广的技术优势，为蛋白质组学的研究提供了可靠的研究手段。近年来，蛋白质组学研究已经从蛋白质简单的定性想精确的定量方向发展，成为蛋白质组学研究领域的热点之一。

　　定量蛋白质组学主要是对生物样品（细胞、组织或体液等）中蛋白质的含量进行比较分析,不仅能鉴定出不同状态下表达的蛋白质, 而且能对其丰度进行精确定量。这对识别功能模块和路径、生物标志物的发现和验证，以及疾病的诊断、监测和治疗等众多领域都具有重要意义。

　　根据定量目的不同，定量蛋白质组学又可分为相对定量和绝对定量两大类。相对定量蛋白质组学，也称为比较蛋白质组学，是指对不同生理或病理状态下，细胞、组织或体液蛋白质的表达量进行相对比较分析。相对定量又可以分为标记定量技术（iTRAQ、TMT和SILAC）和非标记定量技术（Label Free和SWATH），标记定量技术又可以分成体内标记（SILAC）和体外标记（iTRAQ/TMT）两种，绝对定量是指测定蛋白质组中每种蛋白质的绝对量或浓度，包括SRM/MRM方法。